在种苗生产过程中重要的工作是水分管理。
尤其是四角和盘边的孔穴，一定要与中间的孔穴一样，基质不能装的过满，装满后各个格室应能清晰可见。
穴盘苗生产水分管理一般以子叶展开为分界线。
在子叶展开之前的水分管理比较简便，即要穴孔基质的下半部一直保持湿润。仅仅控制穴孔上半部分基质的干湿交替即可。
穴盘育苗是一项新技术。穴盘是分格的，播种时1穴1粒，分苗时1穴1株。通过大量生产实践证明，育苗盘，它与常规育苗相比有以下优点：
（1）---劳动环境，便于手工操作。可坐在温室的休息室内，把穴盘放在操作台上，蔬菜育苗盘，往穴盘里播种或分苗。作业后放到温室里。
（2）节省育苗场地和降低成本。用穴盘播种，让小苗在穴盘里生长，长大后再移入育苗钵、或开沟分苗、或定植；在育苗盘里播种，把籽苗移入穴盘，长大后再移入育苗钵、或开沟分苗
方形穴孔所含基质一般要比圆形穴孔多30%左右，水分分布亦较均匀，种苗根系发育充分。
播种：将种子点在压好穴的盘中，每穴一粒，避免漏播，发芽率偏低的种子每穴播2粒。
覆盖基质：播种后用蛭石覆盖穴盘，方法是将蛭石倒在穴盘上，用刮板从穴盘的一方刮向另一方，去掉多余的蛭石，芽菜育苗盘，覆盖蛭石不要过厚，与格室相平为宜。
育苗盘节省种子用量，降低生产成本。出苗整齐，西瓜育苗盘，保持植物种苗生长的一致性，能与各种手动及自动播种机配套使用，便于集中管理，提高工作效率。移栽时不损伤根系，缓苗迅速，成活率高。
播种后初次浇水：
两个选择方案：种子在苗床上萌发，要先浇少量的水，待穴盘全部移至苗床后，再浇一下次透水。若种子在催芽室或简易催芽空间（草苫覆盖保湿后），那么在进入催芽室之前要浇透水。建议用雾化喷头或喷水细密的喷头。
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